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Biochimie facile

Le cycle de Krebs

Dimitri Garcia 1 min de lecture

Miniature de la vidéo : Cours de biochimie: cycle de Krebs
Vidéo de la chaîne Bio Logique · En lançant la vidéo, vous acceptez le dépôt de cookies par YouTube.

Ce qu’il faut savoir avant

-Terminale S

-Connaitre les grandes bases en bioénergétique, la notion de couplage énergétique

-Vidéo à avoir vu sur le site: La glycolyse

Où ce cours se place

MODULE: METABOLISME CELLULAIRE

CHAPITRE 2: Métabolisme glucidique

Cours: Le cycle de Krebs

Questions fréquentes

Je pense qu’il manque un H+ dans le bilan du cycle.

bonne question et c’est vrai qu’avec la vidéo, je n’ai pas détaillé à ce point. Je vais ici faire le nécessaire pour que tout soit le plus clair possible, en tout cas, j’espère:

Si je reprends rapidement le cycle de Krebs, notez qu’il y a au total 8 réactions.

-La réaction 1 libère 1 H+

-La réaction 2 –> rien à rajouter.

-La réaction 3: au final, il n’est produit que du NADH, pas du NADH,H+ car le H+ sera utilisé lors du départ du CO2, il se retrouvera à ce niveau dans la molécule. Donc, ici, comptez 1 NADH.

-La réaction 4: ici également, je forme du NADH et pas du NADH,H+ car seul 1H est enlevé de l’alpha-cétoglutarate. Il y a une erreur dans mon NADH, H+. OK ? mettez NADH !

-réaction 5 –> rien à rajouter.

-Réaction 6 –> Rien à rajouter

-Réaction 7 –> Rien à rajouter

-Réaction 8 –> on forme du NADH,H+

Donc, au final, on forme 3 NADH et 2 H+

Est-ce-que la réaction faisant passer du pyruvate en l’acetyl-Coa est réversible ?

Bonne question, car dans mes livres de base en biochimie, pas de réponse… Par contre, dans certains livres plus spécialisés: ils indiquent que la réaction est très EXERGONIQUE (-33 kJ.mol-1) et IRREVERSIBLE (car c’est une décarboxylation).

Dans mon cours de biochimie en 1ère supérieure au niveau du bilan du cycle de krebs, il est noté que cela forme 3 H+ et non 2 H+ … erreur du prof ou bien la tienne?

Bonne question, j’avais déjà répondu dans la question 1, mais je préfère revenir dessus pour ne pas que vous soyez dans le…haaaaa il a faux…. ou l’inverse… débat stérile et inutile, surtout avec les éléments de réponses ci-dessous

Les enseignants utilisent diverses sources, et pour ces bilans, et bien, franchement, ce n’est pas si évident que ça… pourquoi…. je vais vous faire la démonstration: Prenez le livre: Stryer (7° édition, page 506) voici le bilan donné:

Vous avez bien les 2H+. (je vous ai donné le détail dans la question 1 juste au-dessus).

Puis, je me suis demandé: Est-ce que tous mes livres de biochimie donne le même bilan avec ce même niveau de détail ? Et regardez !!!

Voici le bilan pris dans un autre très gros livre de biochimie Garrett & Grisham (2° édition, page 659):

SURPRENANT NON ??

et ce n’est pas fini…

j’ai également regardé dans un livre généraliste de classe préparatoire BCPST Michel Breuil (BCPST 1° année, page 522) :

Encore plus SURPRENANT !?!

Tout cela pour vous dire quoi au final: J’ai essayé de vous décortiquer au maximum ce bilan (réponse 1 au-dessus), mais vous voyez que selon les livres, vous avez plus ou moins de détails, et très franchement, pour une L1, je pense que ce qui est à retenir c’est le nombre de NADH, car ce pouvoir réducteur est important pour le bilan en ATP. Le nombre de H+ est plus secondaire, pensez que tout est dynamique dans la cellule, les H+ sont présents, se fixent, sont relargués selon les réactions. Tout se réalise dans un même milieu, et j’ose à peine imaginer ce que ça pourrait être si j’avais la capacité d’être à l’intérieur et de ‘voir’ tout cela… N’hésitez pas à en parler à votre enseignant, savoir ce qu’il considère LUI pour son cours, ce bilan … ou ce bilan… voilà ma réponse, à bientôt !